Apple zažalovala společnost Brick Tower Press, Johna T. Colbyho, který se domáhá zrušení využívání tohoto jména. Colby zakoupil značku iBooks od New Yorského nakladatelství Byron Press, které již publikovalo 1000 fyzických knih pod tímto jménem. Podle stránek společnosti byl v roce 2004 nazván nejrychleji rostoucím malým nakladatelstvím.
Redaktoři z Apple Insider rychle prohledali patentový úřad a úřad průmyslového vlastnictví (tedy jejich obdobu v USA), avšak žádné tyto obchodní značky na Colbyho jméno nenašli. Objevily se však tři obchodní značky Apple. Jedna pro "počítačový (hardware a) software používaný pro podporu a vytváření interaktivních, uživateli modifikovaných elektronických knih", který byl podán v říjnu 1996 společností Family Systems a který byl převeden na Apple. Druhá obchodní značka pokrývá počítače a počítačový hardware z listopadu 1998 a třetí, z dubna 2010 pokrývá široký rozsah zboží a služeb k iBookStoru.
